Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LTBRP36941 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LTBRP36941 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LTBRP36941 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LTBRP36941 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LTBRP36941 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LTBRP36941 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LTBRP36941 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LTBRP36941 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LTBRP36941 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LTBRP36941 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LTBRP36941 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LTBRP36941 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LTBRP36941 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LTBRP36941 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LTBRP36941 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBRP36941 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBRP36941 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBRP36941 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBRP36941 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBRP36941 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBRP36941 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBRP36941 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBRP36941 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBRP36941 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBRP36941 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBRP36941 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBRP36941 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBRP36941 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBRP36941 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBRP36941 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBRP36941 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBRP36941 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBRP36941 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBRP36941 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBRP36941 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBRP36941 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBRP36941 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBRP36941 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBRP36941 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBRP36941 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBRP36941 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBRP36941 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBRP36941 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBRP36941 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBRP36941 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBRP36941 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBRP36941 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBRP36941 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBRP36941 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBRP36941 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBRP36941 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBRP36941 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBRP36941 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBRP36941 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBRP36941 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBRP36941 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBRP36941 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBRP36941 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBRP36941 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBRP36941 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBRP36941 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBRP36941 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBRP36941 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBRP36941 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBRP36941 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBRP36941 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBRP36941 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBRP36941 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBRP36941 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBRP36941 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBRP36941 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBRP36941 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBRP36941 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBRP36941 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBRP36941 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBRP36941 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBRP36941 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBRP36941 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBRP36941 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBRP36941 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBRP36941 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBRP36941 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBRP36941 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBRP36941 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBRP36941 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBRP36941 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBRP36941 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBRP36941 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBRP36941 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBRP36941 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBRP36941 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBRP36941 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBRP36941 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBRP36941 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBRP36941 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBRP36941 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBRP36941 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBRP36941 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBRP36941 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms