Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms