Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TSPOP30536 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TSPOP30536 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TSPOP30536 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TSPOP30536 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TSPOP30536 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TSPOP30536 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TSPOP30536 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TSPOP30536 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TSPOP30536 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TSPOP30536 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TSPOP30536 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TSPOP30536 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TSPOP30536 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TSPOP30536 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TSPOP30536 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TSPOP30536 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TSPOP30536 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TSPOP30536 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TSPOP30536 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TSPOP30536 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TSPOP30536 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TSPOP30536 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TSPOP30536 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TSPOP30536 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
TSPOP30536 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TSPOP30536 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TSPOP30536 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TSPOP30536 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TSPOP30536 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TSPOP30536 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TSPOP30536 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TSPOP30536 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TSPOP30536 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TSPOP30536 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TSPOP30536 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TSPOP30536 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TSPOP30536 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TSPOP30536 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TSPOP30536 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TSPOP30536 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TSPOP30536 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
TSPOP30536 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TSPOP30536 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
TSPOP30536 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TSPOP30536 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TSPOP30536 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TSPOP30536 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TSPOP30536 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TSPOP30536 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TSPOP30536 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TSPOP30536 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TSPOP30536 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TSPOP30536 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
TSPOP30536 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TSPOP30536 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TSPOP30536 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TSPOP30536 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TSPOP30536 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TSPOP30536 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TSPOP30536 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TSPOP30536 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TSPOP30536 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TSPOP30536 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TSPOP30536 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TSPOP30536 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TSPOP30536 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TSPOP30536 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TSPOP30536 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TSPOP30536 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TSPOP30536 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TSPOP30536 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TSPOP30536 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TSPOP30536 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TSPOP30536 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TSPOP30536 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TSPOP30536 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TSPOP30536 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TSPOP30536 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TSPOP30536 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TSPOP30536 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TSPOP30536 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
TSPOP30536 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TSPOP30536 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TSPOP30536 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TSPOP30536 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
TSPOP30536 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TSPOP30536 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TSPOP30536 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TSPOP30536 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TSPOP30536 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TSPOP30536 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
TSPOP30536 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TSPOP30536 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TSPOP30536 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
TSPOP30536 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TSPOP30536 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TSPOP30536 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TSPOP30536 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TSPOP30536 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms