Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHMLP26374 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHMLP26374 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHMLP26374 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHMLP26374 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CHMLP26374 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHMLP26374 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHMLP26374 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHMLP26374 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHMLP26374 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHMLP26374 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHMLP26374 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CHMLP26374 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CHMLP26374 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHMLP26374 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHMLP26374 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHMLP26374 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHMLP26374 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHMLP26374 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHMLP26374 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHMLP26374 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHMLP26374 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHMLP26374 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHMLP26374 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHMLP26374 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHMLP26374 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHMLP26374 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHMLP26374 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHMLP26374 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHMLP26374 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHMLP26374 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHMLP26374 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHMLP26374 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHMLP26374 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHMLP26374 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHMLP26374 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHMLP26374 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHMLP26374 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHMLP26374 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHMLP26374 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CHMLP26374 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHMLP26374 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHMLP26374 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHMLP26374 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHMLP26374 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHMLP26374 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHMLP26374 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHMLP26374 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHMLP26374 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHMLP26374 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHMLP26374 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHMLP26374 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHMLP26374 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHMLP26374 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHMLP26374 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHMLP26374 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHMLP26374 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHMLP26374 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHMLP26374 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHMLP26374 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHMLP26374 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHMLP26374 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHMLP26374 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHMLP26374 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHMLP26374 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHMLP26374 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHMLP26374 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHMLP26374 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHMLP26374 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHMLP26374 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHMLP26374 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHMLP26374 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CHMLP26374 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHMLP26374 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHMLP26374 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHMLP26374 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHMLP26374 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHMLP26374 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHMLP26374 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHMLP26374 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHMLP26374 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHMLP26374 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHMLP26374 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHMLP26374 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHMLP26374 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHMLP26374 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHMLP26374 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHMLP26374 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHMLP26374 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHMLP26374 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHMLP26374 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CHMLP26374 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHMLP26374 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CHMLP26374 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHMLP26374 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHMLP26374 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CHMLP26374 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHMLP26374 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHMLP26374 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHMLP26374 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms