Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms