Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTSSP25774 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTSSP25774 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTSSP25774 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTSSP25774 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTSSP25774 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTSSP25774 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CTSSP25774 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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CTSSP25774 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTSSP25774 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTSSP25774 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTSSP25774 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTSSP25774 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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CTSSP25774 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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CTSSP25774 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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CTSSP25774 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTSSP25774 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTSSP25774 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTSSP25774 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTSSP25774 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTSSP25774 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTSSP25774 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTSSP25774 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTSSP25774 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTSSP25774 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTSSP25774 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTSSP25774 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTSSP25774 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTSSP25774 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTSSP25774 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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CTSSP25774 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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CTSSP25774 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTSSP25774 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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CTSSP25774 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTSSP25774 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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CTSSP25774 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CTSSP25774 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CTSSP25774 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CTSSP25774 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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CTSSP25774 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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CTSSP25774 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTSSP25774 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTSSP25774 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTSSP25774 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CTSSP25774 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTSSP25774 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CTSSP25774 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTSSP25774 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTSSP25774 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTSSP25774 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTSSP25774 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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