Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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