Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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CXCL3P19876 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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CXCL3P19876 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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CXCL3P19876 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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