Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJA1P17302 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJA1P17302 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GJA1P17302 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJA1P17302 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJA1P17302 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJA1P17302 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GJA1P17302 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GJA1P17302 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GJA1P17302 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GJA1P17302 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GJA1P17302 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJA1P17302 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJA1P17302 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJA1P17302 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJA1P17302 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJA1P17302 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJA1P17302 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJA1P17302 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJA1P17302 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJA1P17302 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJA1P17302 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJA1P17302 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA1P17302 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA1P17302 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA1P17302 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA1P17302 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA1P17302 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA1P17302 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA1P17302 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA1P17302 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA1P17302 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA1P17302 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA1P17302 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA1P17302 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA1P17302 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA1P17302 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA1P17302 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA1P17302 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA1P17302 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA1P17302 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA1P17302 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA1P17302 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA1P17302 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA1P17302 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA1P17302 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA1P17302 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA1P17302 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA1P17302 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA1P17302 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA1P17302 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA1P17302 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA1P17302 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA1P17302 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA1P17302 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA1P17302 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA1P17302 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA1P17302 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA1P17302 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA1P17302 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA1P17302 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA1P17302 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA1P17302 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA1P17302 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA1P17302 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA1P17302 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA1P17302 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA1P17302 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA1P17302 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA1P17302 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA1P17302 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA1P17302 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA1P17302 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA1P17302 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA1P17302 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA1P17302 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA1P17302 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA1P17302 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA1P17302 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA1P17302 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA1P17302 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA1P17302 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA1P17302 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA1P17302 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA1P17302 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA1P17302 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA1P17302 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA1P17302 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA1P17302 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA1P17302 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA1P17302 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA1P17302 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA1P17302 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA1P17302 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA1P17302 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA1P17302 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA1P17302 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA1P17302 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA1P17302 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA1P17302 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms