Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms