Protein–RNA interactions for Protein: P11586

MTHFD1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1P11586 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD1P11586 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD1P11586 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD1P11586 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD1P11586 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD1P11586 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD1P11586 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD1P11586 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD1P11586 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD1P11586 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD1P11586 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD1P11586 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD1P11586 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD1P11586 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD1P11586 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD1P11586 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD1P11586 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD1P11586 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD1P11586 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD1P11586 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD1P11586 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD1P11586 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD1P11586 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD1P11586 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD1P11586 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD1P11586 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD1P11586 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD1P11586 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD1P11586 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD1P11586 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD1P11586 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD1P11586 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD1P11586 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD1P11586 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD1P11586 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD1P11586 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD1P11586 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD1P11586 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD1P11586 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD1P11586 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD1P11586 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD1P11586 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD1P11586 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD1P11586 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD1P11586 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD1P11586 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD1P11586 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD1P11586 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD1P11586 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD1P11586 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD1P11586 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD1P11586 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD1P11586 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD1P11586 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD1P11586 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD1P11586 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD1P11586 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD1P11586 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD1P11586 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD1P11586 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD1P11586 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD1P11586 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD1P11586 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD1P11586 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD1P11586 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD1P11586 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD1P11586 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD1P11586 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD1P11586 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD1P11586 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD1P11586 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD1P11586 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD1P11586 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD1P11586 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD1P11586 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD1P11586 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD1P11586 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD1P11586 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD1P11586 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MTHFD1P11586 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MTHFD1P11586 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MTHFD1P11586 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MTHFD1P11586 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MTHFD1P11586 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MTHFD1P11586 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MTHFD1P11586 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MTHFD1P11586 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MTHFD1P11586 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MTHFD1P11586 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MTHFD1P11586 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MTHFD1P11586 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MTHFD1P11586 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MTHFD1P11586 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
MTHFD1P11586 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MTHFD1P11586 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MTHFD1P11586 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MTHFD1P11586 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MTHFD1P11586 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MTHFD1P11586 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MTHFD1P11586 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms