Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

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Length 1,744 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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