Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms