Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
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