Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 KRTAP4-4-201ENST00000390661 1081 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms