Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms