Protein–RNA interactions for Protein: G5E9R7

KRTAP4-16, HCG2042993, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-16G5E9R7 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-16G5E9R7 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms