Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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C4orf47A7E2U8 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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C4orf47A7E2U8 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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C4orf47A7E2U8 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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C4orf47A7E2U8 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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C4orf47A7E2U8 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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C4orf47A7E2U8 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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