Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 DCAF4-203ENST00000394234 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms