Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms