Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms