Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TUBE1Q9UJT0 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TUBE1Q9UJT0 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TUBE1Q9UJT0 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TUBE1Q9UJT0 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
TUBE1Q9UJT0 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TUBE1Q9UJT0 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TUBE1Q9UJT0 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TUBE1Q9UJT0 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TUBE1Q9UJT0 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TUBE1Q9UJT0 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TUBE1Q9UJT0 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TUBE1Q9UJT0 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TUBE1Q9UJT0 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TUBE1Q9UJT0 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TUBE1Q9UJT0 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TUBE1Q9UJT0 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TUBE1Q9UJT0 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TUBE1Q9UJT0 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TUBE1Q9UJT0 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TUBE1Q9UJT0 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TUBE1Q9UJT0 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TUBE1Q9UJT0 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TUBE1Q9UJT0 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TUBE1Q9UJT0 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TUBE1Q9UJT0 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TUBE1Q9UJT0 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TUBE1Q9UJT0 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms