Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms