Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms