Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

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Length 774 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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HCN3Q9P1Z3 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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HCN3Q9P1Z3 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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HCN3Q9P1Z3 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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HCN3Q9P1Z3 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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HCN3Q9P1Z3 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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HCN3Q9P1Z3 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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HCN3Q9P1Z3 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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HCN3Q9P1Z3 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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HCN3Q9P1Z3 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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HCN3Q9P1Z3 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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