Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 AC010181.2-201ENST00000483759 482 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms