Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE1

MMP26, Matrix metalloproteinase-26, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP26Q9NRE1 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms