Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms