Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
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