Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms