Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 MYO9B-201ENST00000397274 7532 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 NUMA1-205ENST00000393695 7343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 BCORL1-201ENST00000218147 6860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 ACVR2A-201ENST00000241416 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 GPR161-209ENST00000539777 7655 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 FNIP1-205ENST00000615660 6589 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 STOX2-201ENST00000308497 10458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 CACNA1G-219ENST00000507609 6849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.9 ms