Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVR0

HERC2P3, Putative HERC2-like protein 3, humanhuman

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Length 1,158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2P3Q9BVR0 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC2P3Q9BVR0 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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