Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms