Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms