Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.05■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MCMBPQ9BTE3 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms