Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms