Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms