Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 RGS6-201ENST00000343854 5342 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 ARHGEF33-201ENST00000398800 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 NFE2L1-203ENST00000362042 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 SLC4A2-204ENST00000461735 4387 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 AP000350.6-201ENST00000609510 5637 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 VSTM4-202ENST00000332853 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC10.28□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC10.28□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 SLC44A3-AS1-215ENST00000634870 5956 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 OGFR-202ENST00000370461 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 DPY19L1-201ENST00000310974 4870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 PLCXD1-203ENST00000399012 5287 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 NBN-201ENST00000265433 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 NTRK2-208ENST00000395882 7111 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 ZNF41-202ENST00000377065 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 UBE3B-203ENST00000434735 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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