Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBC4

UBA3, NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit, humanhuman

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA3Q8TBC4 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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