Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms