Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG87

PAPD7, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPD7Q5XG87 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPD7Q5XG87 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPD7Q5XG87 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPD7Q5XG87 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPD7Q5XG87 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPD7Q5XG87 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPD7Q5XG87 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPD7Q5XG87 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPD7Q5XG87 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPD7Q5XG87 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPD7Q5XG87 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPD7Q5XG87 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPD7Q5XG87 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPD7Q5XG87 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPD7Q5XG87 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPD7Q5XG87 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPD7Q5XG87 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPD7Q5XG87 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPD7Q5XG87 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPD7Q5XG87 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPD7Q5XG87 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPD7Q5XG87 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPD7Q5XG87 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPD7Q5XG87 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPD7Q5XG87 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPD7Q5XG87 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPD7Q5XG87 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPD7Q5XG87 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPD7Q5XG87 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPD7Q5XG87 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPD7Q5XG87 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPD7Q5XG87 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPD7Q5XG87 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPD7Q5XG87 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPD7Q5XG87 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPD7Q5XG87 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPD7Q5XG87 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPD7Q5XG87 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPD7Q5XG87 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPD7Q5XG87 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPD7Q5XG87 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPD7Q5XG87 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPD7Q5XG87 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPD7Q5XG87 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPD7Q5XG87 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPD7Q5XG87 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPD7Q5XG87 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPD7Q5XG87 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPD7Q5XG87 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPD7Q5XG87 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPD7Q5XG87 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPD7Q5XG87 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms