Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms