Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms