Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6CQ53S08 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms