Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTXN3Q4LDR2 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms