Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms