Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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