Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
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