Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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HIST3H3Q16695 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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HIST3H3Q16695 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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HIST3H3Q16695 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
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HIST3H3Q16695 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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