Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FXNQ16595 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FXNQ16595 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FXNQ16595 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FXNQ16595 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FXNQ16595 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FXNQ16595 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FXNQ16595 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FXNQ16595 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FXNQ16595 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FXNQ16595 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FXNQ16595 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FXNQ16595 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FXNQ16595 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FXNQ16595 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FXNQ16595 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FXNQ16595 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FXNQ16595 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FXNQ16595 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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FXNQ16595 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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FXNQ16595 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FXNQ16595 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
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FXNQ16595 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FXNQ16595 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FXNQ16595 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FXNQ16595 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FXNQ16595 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FXNQ16595 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FXNQ16595 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
FXNQ16595 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FXNQ16595 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FXNQ16595 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FXNQ16595 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FXNQ16595 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FXNQ16595 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FXNQ16595 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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FXNQ16595 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FXNQ16595 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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FXNQ16595 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FXNQ16595 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FXNQ16595 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FXNQ16595 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FXNQ16595 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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FXNQ16595 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FXNQ16595 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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FXNQ16595 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FXNQ16595 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FXNQ16595 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FXNQ16595 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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FXNQ16595 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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FXNQ16595 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FXNQ16595 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FXNQ16595 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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FXNQ16595 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FXNQ16595 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
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FXNQ16595 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FXNQ16595 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FXNQ16595 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FXNQ16595 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FXNQ16595 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FXNQ16595 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FXNQ16595 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FXNQ16595 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FXNQ16595 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FXNQ16595 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FXNQ16595 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FXNQ16595 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FXNQ16595 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FXNQ16595 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FXNQ16595 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FXNQ16595 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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